Πρόταση 7: ARTA
Ανθεκτικότητα σε αντιβιοτικά: Οδοί μεταφοράς στον Αμβρακικό κόλπο
Πότε: Ιούλιος 2022
Πού: Αμβρακικός κόλπος
Τι: Δειγματοληψία νερού για την επεξεργασία μικροβιακού γενομικού υλικού (DNA)
Ποιος: National Institute of Oceanography and Applied Geophysics – OGS, Trieste, Italy και Ελληνικό Κέντρο Θαλάσσιων Ερευνών (ΕΛΚΕΘΕ), Ηράκλειο και Ανάβυσσος Αττικής
Στο έργο ARTA που χρηματοδοτήθηκε από το "RePhil" έγινε χρήση του Ω/Σ ΦΙΛΙΑ με σκοπό την συλλογή θαλασσινού και γλυκού νερού και την «χάραξη» των οδών μεταφοράς βακτηρίων που παρουσιάζουν ανθεκτικότητα σε αντιβιοτικά.
Πράγματι, η μαζική χρήση αντιβιοτικών στις μέρες μας έχει οδηγήσει στην ανάπτυξη βακτηρίων που έχουν αποκτήσει συγκεκριμένα γονίδια ώστε να αμύνονται στα αντιβιοτικά. Αυτό το φαινόμενο έχει προκαλέσει παγκόσμια ανησυχία. Καθώς μια από τις μεγαλύτερες πηγές τέτοιων βακτηρίων στην παράκτια ζώνη είναι το γλυκό νερό, σε αυτήν την μελέτη επιλέχθηκε ο Αμβρακικός κόλπος που ως γνωστόν επηρεάζεται από την εισροή γλυκού νερού από τους δύο ποταμούς Άραχθος και Λούρος.
Οι δραστηριότητες στο Ω/Σ ΦΙΛΙΑ περιλάμβαναν τον χαρακτηρισμό των φυσικών ιδιοτήτων του νερού με χρήση CTD (ένας πολύ-παραμετρικός αισθητήρας χρησιμοποιήθηκε για τις μετρήσεις της θερμοκρασίας, αλατότητας, συγκέντρωσης του οξυγόνου και του φθορισμού της χλωροφύλλης σε αληθινό χρόνο).
Οι μετρήσεις έγιναν σε αυξανόμενη απόσταση από τις εκβολές των ποταμών. Στα ίδια σημεία και σε διάφορα βάθη συλλέχθηκε νερό με σκοπό την εκχύλιση του μικροβιακού γενομικού υλικού (DNA) και τον μετέπειτα (πιθανό) εντοπισμό βακτηριακών γονιδίων που προσδίδουν ανθεκτικότητα σε αντιβιοτικά. Νερό συλλέχθηκε επίσης για βιογεωχημικές αναλύσεις (εκτίμηση της συγκέντρωσης των θρεπτικών, της χλωροφύλλης και του σωματιδιακού υλικού) και βιολογικές αναλύσεις (ποσοτικός και ποιοτικός χαρακτηρισμός της ιικής, βακτηριακής και ευκαρυωτικής κοινότητας), ώστε αυτές να συνοδεύσουν και υποστηρίξουν τον εντοπισμό των γονιδίων.
